南京和香港都是中国重要的经济中心，文化、商业和法律制度相似。因此，在两地之间设立公司有很多优势。南京香港公司的注册可以帮助企业更方便地跨越两地经济制度的障碍，获得更多的商业机会和利益。

南京香港公司注册的优势主要表现在以下三个方面:

1. 税收优惠政策

中国大陆和香港由于地域和税制的不同，提供了许多税收优惠政策。设立南京香港公司，可以充分利用两地的税收优惠政策，减轻税负，增加企业利润。例如，香港公司在香港的收入只需要缴纳16.5%的公司税，除非收入来自香港以外，否则无需缴纳地方税;在中国大陆，企业所得税的最高税率为25%，企业所得税的高税率已经成为跨境投资的瓶颈之一。

2. 经济繁荣地区

南京和香港都具有经济繁荣的特点，都有各自的优势产业和产业链。南京是国家科技创新城市，制造业、高新技术产业和先进装备制造业发达。香港作为国际金融中心和自由贸易区，是通往全球市场的重要门户和适合跨境贸易的枢纽。南京香港公司的成立可以结合两地的优势，将企业的生产线和产品销售扩展到全球，使企业走向国际化。

3.法律和财务保证

南京和香港有着不同的法律和金融体系。南京地处中国中部，实行国家法律制度，实行社会主义市场经济。香港是“一国两制”的特别行政区，实行英联邦法律制度。注册南京香港公司可以同时享受两地的法律和金融制度，并为跨国投资提供额外的保护。

南京香港公司注册有以下步骤:

1. 选择公司类型

南京和香港的公司注册可以通过在香港设立外商投资公司或在南京注册“港资公司”进行。外商投资公司注册时，需向香港特别行政区政府申请公司注册，并按照香港外商投资公司管理政策办理;在南京注册“港资公司”，应适用中华人民共和国的有关法律法规，并按照台湾、香港、澳门等境外投资企业的注册程序办理。

2. 确定公司名称

南京香港公司在注册时需要确认公司名称。在确定公司名称时，要遵守两地的相关法规和内部法律，根据企业的主营业务和经营范围，选择简洁有力的公司名称。

3.提交注册材料

南京香港公司在注册时需要提交一系列材料，主要包括:公司章程、注册资本、公司地址、公司董事或股东的身份证明和地址、公司管理和税务登记申请表、信托证书和银行账户、营业执照申请书、组织机构代码证等相关证明文件。

4. 申请公司银行账户

南京香港公司注册后，需要申请公司银行账户，并准备商业银行所需的相关文件和证明。这一步需要耐心和时间，因为在不同的银行申请账户可能需要不同的时间，而且有些银行还需要进行面试和审查信息。